انتشرت فيروسات أنفلونزا الخيول أولاً إلى الخيول من الطيور أصابت فيروسات أنفلونزا الطيور A(H3N8) المنتشرة في الطيور الخيول، وتكيفت تلك الفيروسات في النهاية مع الخيول وبدأت تنتشر بانتظام في الخيول مثل فيروسات أنفلونزا الخيول A(H3N8). تم عزل هذه الفيروسات لأول مرة من الخيول في عام 1963. ويمكن أن تحدث العدوى نتيجة التعرض لعاب ومخاط الحيوانات المصابة.
في أواخر التسعينيات، أصاب فيروس EIV H3N8 الكلاب وتكيف معها وبدأ ينتشر فيها بانتظام باعتباره فيروس أنفلونزا الكلاب A(H3N8). ومع تكيف فيروسات H3N8 مع كل مضيف، أصبحت فيروسات H3N8 الموجودة في الطيور والخيول والكلاب مختلفة ومتميزة عن بعضها البعض. في حين أن فيروسات H3N8 المختلفة تستمر في الانتشار في الطيور والخيول، فإن فيروس أنفلونزا الكلاب H3N8 انقرض الآن في الكلاب.