تتعرض الخيول لعدد من الأمراض، أوجزتها هيئة الخدمات البيطرية التابعة لوزارة الزراعة المصرية في الأمراض التالية:
1- مرض طاعون الخيول
2- إنفلونزا الخيول
3- مرض الالتهاب الرئوي الفيروسي
4- مرض حمى غرب النيل
5- مرض التهاب الشرايين
6- مرض السعار
7- مرض خناق الخيل
8- مرض دورين والتهاب الدماغ والنخاع
9- أنيميا الخيول
10- التهاب الفم الحويصلي
11- مرض الرعام والحمى الفحمية
12- الالتهاب الرحمي المعدى.
